石河子大学机械电气工程学院具有悠久的办学历史，其前身为1959年成立的中国人民解放军新疆生产建设兵团农学院农业机械化系。1996年9月石河子大学成立后更名为石河子大学工学院机械电气工程系。2001年成立机械电气工程学院。

学院设有4个系、3个办公室、1个图书资料室和1 个CAD。拥有国家教育部工程1个；省实验室1个、检验测试1个、职业技能鉴定站1个；精品课程2门；特色专业1个、品牌专业1个、精品课程3门、一类课程6门；二级学科硕士学位点3个；农业工程与农业推广专业硕士点2个；农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化与工业工程4个本科专业；并设有成人教育及高等职业教育，形成了研究生教育、本科生教育、高职教育等多层次多形式的办学格局。

石河子大学机械电气工程学院实验源于1959年原石河子农学院农机系农机化专业实验室，是在机械电气工程学院现有机械工程实验、电气工程和工程训练的基础上组建而成的。由于实验在产、学、研和大学生创新能力、实践动手能力等综合素质培养方面取得了可喜的成绩并形成了特色。2005年，在实验建设的基础上取得了“兵团农业机械实验室”和“兵团农业机械检测”，2006年又取得了“绿洲经济作物生产机械化教育部工程研究”,2008年进入校级实验教学示范建设行列。